10月16日上午，青岛市召开新闻发布会，山东省卫生健康委党组副书记、省疾病预防控制中心党委书记马立新会上通报此次青岛疫情的源头。经比对分析证实，此次疫情与青岛港9月感染者病毒基因序列高度同源。
马立新表示，经国家和省联合专家组综合现场流行病学调查、大数据排查和实验室检测结果分析，判定青岛本起疫情是一起医院聚集性疫情，排除有社区传播传入医院内的可能性。证据表明，本起疫情的病例及接触者与9月份青岛港疫情的相关人员在医院外不存在时间和空间关联。调取的青岛市胸科医院监控录像证实，青岛港疫情两名感染者在市胸科医院隔离观察期间离开封闭病区，到CT室检查，因防护消毒不规范，导致CT室被病毒污染，进而传染了次日上午到同一CT室检查的住院病人李某某和陪护牛某某，并将病毒带入结核病区，导致这次疫情在医院内传播。